當美東時間1日下午約3時，載藉海軍海豹特攻隊(Navy SEALs)直升機飛近賓拉丹藏身的豪華堅固別墅時，突然發生故障，必須降落在敵我不分的陣地時，遠在美國華府白宮戰情室(situation room)觀看戰況的人，全部鴉雀無聲，歐巴馬與國安團隊都安靜下來，等著直升機重新再發動，所有人屏息觀注，白宮反恐總監布瑞南(John Brennan)說，簡直是「度秒如日」，生怕重演過去營救任務失敗的悲劇。
歐巴馬總統(左) 和他的國安團隊，全程監看狙殺賓拉登的經過。
白宮一名官員說，直升機被迫降落地面，特攻隊出了直升機直奔別墅，至於能不能搭同架直升機脫險回去都不重要，行動有如箭已上弦，不能回頭。
白宮官員指出，雖然沒人看過他進出，但綜合情報分析都指出這是賓拉丹藏匿點。歐巴馬總統為此事在過去七周和國安團隊先後開了至少九次極機密的行動會議，其他小型會議不計其數，歐巴馬親自了解行動的每一細節。開會時間先後是3月14日、3月20日、4月12日、4月19日、4月28日。官員指出，行動方案有多套備案，最早是以炸彈方式擊毀整棟建築，各有利弊，大家意見不一，各但歐巴馬最後否決這套行動，「直升機一案比較危險，難度較高」，官員指出，「但總統要看到證據，死要見屍，他不想看到一堆瓦礫」，然後告訴他說「賓拉丹已在瓦礫裡」。
在4月19日的會議上，歐巴馬總統下達進攻令，批淮以直升機載運特攻隊的方案，對賓拉丹發動攻擊。4月29日，在歐巴馬前往阿拉巴馬州視察龍捲風災之前，他再次召集國安團隊表示展開擊殺賓拉丹行動。原定發動時間是美東時間4月30日晚上，當晚也正是歐巴馬總統不動聲色地在白宮記者俱樂部大開玩笑，嘲弄自己出生地之際，座中上千記者與嘉賓開懷大笑，卻不知擊殺或逮捕賓拉丹行動的大新聞已將發生。
但4月30日的行動因為天候關係，延後一天。
白宮總統行事曆電郵顯示，那天一整天，歐巴馬都在盯著此行動：下午3時50分，總統第一次被告知，賓拉丹可能在別墅裡；晚上7時01分，歐巴馬被告知「高價值目標」(HVT)就是賓拉丹(UBL)。5月1日，歐巴馬一早9時42分就去打高爾夫球。下午2時4分回到白宮，對外表示今天下午都沒有公開活動。
但歐巴馬已經坐在白宮戰情室，跟他在一起的有：幕僚長戴利、國安顧問唐尼隆、國防部長蓋茲、國務卿喜萊莉、三軍參謀聯席會議主席穆倫等人。中央情報局長潘尼達則坐鎮中情局總部。攻擊行動開始，戰情室內氣氛沉重。
獵捕賓拉丹的行動由美軍海豹攻擊隊第六分隊(SEALs Team Six)擔任主力，中情局局長潘尼達親自指揮。
四架載著24名海豹成員的直升機，當天深夜從巴基斯坦西北部的加齊空軍基地出發，凌晨1時時15分左右飛抵首都伊斯蘭馬巴德北部約60公里的市郊小鎮阿伯塔巴德。
當海豹特攻隊進入別墅時還不能百分之百確定賓拉丹在那裡，但他們很快逐屋搜索，最後在二樓一間房子裡找到賓拉丹，喝令他投降就範，但他開槍試圖反抗，在一陣短暫交火後，賓拉丹先是腹部中彈，接著頭部又中了致命的一槍，賓拉丹倒地不起，他的妻子也中彈喪命。官員指出，特攻隊員頭盔上配備攝影鏡頭，過程全都露。錄影的定格照片傳回華府，證明任務成功，歐巴馬親眼看到賓拉丹的照片。歐巴馬的反應是，「我們逮到他了」。
特攻隊立即掌握賓拉丹的屍體，另部分隊員則在房內及其他房間搜尋賓拉丹的文件與電腦硬碟等價值重要的情資。這些文件有助中情局分析研究，希望找到凱達第二號人物札瓦希里藏匿的線索。最後帶賓拉丹屍體登機離去。在離開前，炸毀那架機械故障而飛不走的黑鷹直升機。白宮官員表示，整個行動不到40分鐘，非常順利。
當特攻隊長報告行動成功後，白宮戰情室與中情局的會議室爆發一陣巨大的歡呼聲和掌聲，大家相互道賀。
官員表示賓拉丹其中一名兒子和另外三名男子同時被殺，包括賓拉丹的兄弟和信差。別墅內尚有女性和兒童。但在行動中沒有美方人員傷亡。
當地居民說，當時「先聽到一聲雷鳴般的巨響，不久市內傳出一連串急速機槍開火聲，槍聲一度停下，但隨後再聽到一聲巨響，一會後傳出更的大爆炸聲！」 許多當地居民目擊事發經過，指當時戰況短暫而激烈。特攻隊員登機把賓拉丹屍體帶到軍艦上，採取賓拉丹DNA樣本，並以適當程序處理屍體後，把賓拉丹海葬在北阿拉伯海，海葬過程有錄影存證。
英國廣播公司(BBC)報導稱，當時有目擊者稱看見數架直升機低飛，讓當地居民十分害怕。直升機在大宅附近降落後，特攻隊員隨即出現，要求居民關掉家中電燈，不要離房外出。
不久後，居民便聽見重火力武器的槍聲，似乎是來自直升機的火箭，轟炸目標，賓拉丹的護衛急著跑上天台開火還擊。美國有線新聞網(CNN)播出畫面，顯示賓拉丹的別墅在激戰後著火及冒出濃煙。特攻隊登機把賓拉丹的屍體被帶到美軍軍艦，進行確認與海葬。
