11月5日，國務院任免國家工作人員，任命許寧生為復旦大學校長，免去楊玉良的復旦大學校長職務;免去許寧生的中山大學校長職務。
62歲的楊玉良離職十分突然，接任他的許寧生更是毫無準備。
楊玉良本可以再干一屆
過去一年來，復旦大學負面事件頻出，處於輿論的風口浪尖。院士涉嫌造假，被指謊報科研經費，人工耳蝸涉嫌抄襲事件鬧得沸沸揚揚，隨後中紀委首次設立專項巡視組對復旦大學進行巡視。紛擾的負面事件讓復旦大學如坐針氈，楊玉良作為校長，則首當其衝。
復旦大學相關人士告訴本報記者，其實楊玉良本可以再干一屆，他62歲，還是中科院院士，與之相比，前任校長王生洪67歲卸任，並非院士。楊玉良是土生土長的復旦人，2009年1月擔任復旦大學校長，任職共5年零九個月。其2003年被選為中國科學院院士。
楊玉良在卸任演說中稱，「我痛恨一切形式的貪污腐敗，尤其是高校當中的、知識分子的貪污腐敗……但是復旦需要發展，我們需要向前看，考慮到大局而有許多事情暫時還沒做，也有很多該做而來不及做……我相信『人在做，天在看』，凡是貪污腐敗分子，必定無可逃遁!」楊玉良在講話中透露，自己向上級領導們做過承諾，會不動聲色地配合做好復旦校長的更替工作，但是「此時此刻，沒有必要『不動聲色了』」，「也許三五年或者更長的時間以後，自然會有對我的正確評價」。這似乎透露出他的一些無奈。
被塞滿的舉報箱
在楊玉良突然離職前兩周，復旦大學黨委剛剛向中紀委提交了一份整改報告。「復旦大學被要求9月底上報，但報告只移送了實驗動物部幾個人的經濟問題，聽說有關部門很不滿意。」消息人士說，中紀委專項巡視組入駐復旦大學的時候，舉報箱被舉報者塞滿，「得用棍子往裡面戳。」
在中央巡視組巡視復旦大學前，復旦大學的王正敏院士被學生王宇澄舉報學術造假、學歷造假、抄襲國外人工耳蝸技術鬧得沸沸揚揚。王宇澄曾告訴本報記者，他和其他幾位院士曾給楊玉良寫過舉報信，但沒有獲得回復。復旦大學學術委員會公布調查結果稱：王正敏的專著和院士申請材料中的確存在學術不規範問題，但不能判斷為造假。
與楊玉良卸任幾乎同時，10月20日，一個名為「復旦大學良心何在」的話題組在新浪微博上創建，近600條帖子反映復旦大學欺騙2014年新入學研究生，降低《入學手冊》上承諾的獎學金金額及每月生活津貼金額，減少幅度超過承諾數額的一半，「承諾的生活補助從2000元變成1200元，每人都有的獎學金從10000元，變成2500元。」
知情人士稱，這是因為中央巡視組來了，學校發不了那麼多錢。華商晨報
王岐山曾派親信專項巡視復旦大學
今年3月31日至5月8日，中共中紀委書記王岐山的親信董宏帶領第十二巡視組進駐上海，展開對復旦大學為期1個月的專項巡視工作。
董宏曾長期擔任王岐山的「大秘」。王岐山擔任廣東省副省長、國務院體改辦主任、海南省委書記、北京市市長期間，董宏一路跟隨並擔任過廣東省政府副秘書長、國務院體改辦產業司司長、海南省委副秘書長、北京市政府副秘書長等職務。
7月6日，董宏等向復旦反饋巡視結果稱，主要問題包括科研經費管理使用混亂，違規現象突出，存在腐敗風險;江灣校區基建工程嚴重違規;校轄附屬醫院攤子大、權屬雜、監管難，極易誘發腐敗等。
10月10日，復旦大學在其官網公布《中共復旦大學委員會關於巡視整改情況的通報》，對中央巡視工作領導小組此前反饋的復旦大學江灣校區基建工程嚴重違規、科研經費管理使用混亂、校轄附屬醫院監管難等問題回應了整改情況。
10月21日，中共官媒在披露科研經費貪腐問題時特別提到，2014年上半年，中央巡視組在對復旦大學的專項巡視中發現，該校科研經費管理使用混亂現象突出：經核查，2008年至2013年，復旦大學有25個項目在同一時間多渠道申請獲得資助，屬於重複申報課題。
外界關注，復旦大學可能有人會因為巡視組所發現的諸多問題而被查處。不過，目前尚無證據表明楊玉良卸任與這次專項巡視有關。
復旦大學附屬中山醫院涉嫌活摘器官
上海中山醫院是上海復旦大學附屬醫院之一，該醫院是上海最有「名氣」的醫院之一，和上海華山醫院等齊名。中山醫院自稱是全國最早開展器官移植的單位之一。
大紀元2007年報導，據可靠的內部消息，該醫院每天可以做到一例及以上心臟器官的換心手術。一般換心的等待時間只要十天左右。
2013年9月11日，追查國際關於中共活體摘取法輪功學員器官證據專輯中披露了追查國際調查員對中山醫院肝臟移植中心調查的部分錄音。錄音顯示，中山醫院涉嫌活摘法輪功學員器官的滔天大罪。
上海是中共前黨魁江澤民的老巢，而活摘法輪功學員器官等反人類罪是江澤民集團的核心罪行。中共十八屆四中全會於10月23日剛剛結束，復旦大學校長突然換人，中南海或在釋放圍剿江澤民的信號。大紀元
