2月13日，官媒新華網首頁通報，天津檢察機關對孫政才提起公訴。檢方指他整個仕途「一路受賄」，預計會有多人涉案。重慶市委會議傳達有關內部文件說必須「予以嚴懲」。海外評論人士普遍認為，孫政才刑期可能不會低於被判處無期徒刑的周永康和令計劃。另外，有大陸消息人士披露，在引進美國孟山都基因改造進入中國這一事上，立下汗馬功勞。還有海外黨媒報導，孫政才涉北京市委副書記呂錫文案，並和郭文貴有隱秘牽扯。
天津檢方指控，孫政才任中共北京市順義區委書記、北京市委常委、市委秘書長、農業部部長、吉林省委書記、政治局委員、重慶市委書記等職時，為他人謀取利益，非法收受他人巨額財物，應以「受賄罪」追究其刑事責任。
從孫政才的簡歷上看，其從2002年開始任北京市順義區委書記，換句話說，他從15年前就開始收受巨額財物，這也意味著，他幾乎在整個仕途都在「受賄」。同時，他也是利用中央政治局委員身份收錢的高官。
今年2月12日，中共重慶市委常委會召開擴大會議，傳達中共中央辦公廳有關對孫政才被提起公訴的通報，再次強調「堅決肅清孫政才惡劣影響和『薄、王』思想遺毒」。
此前，孫政才被官方通報指「腐化墮落，搞權色交易」。近期中共官媒點名說，「錢色」、「權色」通吃的「雙色」老虎中最出名的莫過於周永康、令計劃和孫政才。
對於孫政才的刑期，普遍認為，可能不會低於被判處無期徒刑的周永康和令計劃。
時政評論員陳思敏認為：而從孫政才的從政經歷來看，其江派色彩濃重，在江派大老賈慶林任北京書記期間被提拔為北京市委常委、秘書長，在劉淇任內當了4年北京市委常委、秘書長，履新吉林省委書記當天，首先去拜江澤民碼頭長春一汽，吉林官方項目大量輸送利益給劉雲山兒子，接替張德江任重慶書記的後台則是曾慶紅。
孫政才引進美國孟山都基因改造；拿中國人做生死試驗場
孫政才2006年至2009年孫政才擔任中國農業部部長。曾有大陸消息人士披露，在引進美國孟山都基因改造進入中國這一事上，立下汗馬功勞。
2009年11月，中國農業部曾批准兩種基因改造水稻、一種基因改造玉米的安全證書。「中國成為國外基因改造糧的生死試驗場」引發人們的恐慌。
而這份官方文件表明，拿國人生命健康不當回事的，是時任農業部長是孫政才。
2009年9月，孫政才訪問美國農業部時均受到孟山都公司的專機接待。並同時飛往康奈爾大學探望讀書的孩子。
據稱，該大學學費每年5萬美元，加上生活費每年2萬美元，每年至少要7萬美元，孫政才當時的薪水收入如何能供應？
工程院院士李寧套取基因改造資金被捕；
江澤民主政；農業部為各類基因改造農作物頒發安全證書
2008年啟動的基因改造重大專項，預計在若干年內投資200億元用於基因改造研究。
2014年李寧因虛假套取基因改造專項資金被捕。而他拿到的國家級重大專項最多、擔任重大專項主要工程師最多的時間，是從2006年到2011年。此一時期，農業部顯然是孫政才主政的全時期。
與此同時，李寧也被曝名下至少4家公司來接受基因改造經費巨款。
另據中國農業大學內部信息顯示，2008年1月，孫政才曾以農業部及其個人名義發賀信，祝賀李寧當選中國工程院院士。
有報導指出，在基因改造研究領域成為領軍人物的李寧，其重要支持者是中科院副院長李家洋。李家洋的後台有安徽農業大學（原農學院）的校友資金被捕，以及交情匪淺的同事中科院實權人物江綿恆。
據報導，農業部為各類基因改造農作物頒發安全證書，始於江澤民主政時的1996年。而孫政才在農業部的前任杜青林，被認為是基因改造的首要推手，在其治下的2004年以推廣基因改造技術為主的美國孟山都公司開始有計劃地打入中國。
黨媒：孫政才郭文貴在北京圈地
編輯部在北京的海外黨媒多維披露，2002年到2006年，孫政才除擔任北京市委常委外，還擔任市委秘書長兼市直機關工委書記，是名副其實的市委「大管家」。
2015年年底，中共北京市委副書記呂錫文涉嫌嚴重「違紀」落馬。在呂錫文擔任西城區委書記的數年間，孫政才正擔任市委秘書長，兩人為同事關係，有工作上的交集。
曾有大陸媒體披露，呂錫文建立了一個西城區的「地產官商圈子」，圍繞北京市金融街進行地產腐敗。
而這一時期還有一位關鍵人物就是郭文貴。也正在看好北京奧運周期的發展機遇，郭文貴從鄭州北上，在毗鄰北京奧運中心的黃金地塊拿下了摩根中心和金泉廣場，但因資金短缺等問題，摩根中心被北京市政府收回，傳出北京首創拿下了重新招標的這一地塊。
事件之後，主抓奧運工程的北京原副市長劉志華被雙規，首創董事長劉曉光也被協助調查。均是郭文貴在背後政商運作的結果，時任北京市警局副局長的張越，便是郭氏朋友圈中的一員。
兩個黃金地塊重新回到郭文貴手中。
表面上來看，呂錫文案和郭文貴案並無關聯。但有政情觀察人士表示，這些案件背後與時任北京市委秘書長的孫正才恰恰存在著某種較為隱秘的邏輯聯繫。
另外，2017年，在孫政才落馬前，郭文貴還在直播視頻中曾大讚孫政才的政治智慧和政治能力，說他是「天才中的天才「。
郭文貴說，如果孫政才將來能夠成為中國的總理或者中共總書記，「是中華民族之幸「。
