李自成率兵轉戰南北,軍隊中卻少有染上瘟疫的。清朝的文獻中沒有關於闖王軍隊死於瘟疫的記載,明朝的地方志中有些許記載。但沒有任何史料記載李自成的軍隊是如何抵禦瘟疫的,明末的那場鼠疫對李自成軍並沒有造成多大的傷害。清軍從關外一路殺來,入關,和明軍交戰,過程中竟無一人染上瘟疫。鼠疫的傳染性極強,那時的人們也沒有什麼隔離措施,哪怕只有一人染上,都會在短時間內染遍全軍。神奇的是,瘟疫似乎沒有把清軍納入消滅對象,而是劍鋒直指大明王朝。