在1949年前的清華校園裡,教授治校。教授們可以在思想不受禁錮的環境下進行獨立的研究,發表學術成果也不會受到官方的限制。學生們可以自由地選擇喜歡學科。學校鼓勵學生獨立思考和發表對學術和社會問題的觀點和看法。和其它所有的大陸大學一樣,1949年以後的清華校園裡,無論是學術研究,教學課程設置還是行政管理都是在黨委的控制之下。官方實行「獨尊馬列,罷黜百家」。用馬列毛思想對知識分子進行所謂思想改造,對學生進行政治洗腦。