D3115非正點運行
新華社記者問：「本應在D3115之前的D301為何會行駛在後面並發生追撞?車站調度是否有問題?中國高鐵、動車是否存重大安全隱患?」
中共鐵道部有關負責人回答：「由於D301次列車晚點，導致D301次列車行使在正點運行的D3115次之後。後方運行的D301次列車由於信號顯示錯誤與D3115次發生追撞。這起事故也反映出現場作業控制不力，人員應急處理的素質有待進一步提高，說明有些鐵路企業的安全基礎還比較薄弱，鐵路部門一定要吸取血的教訓，切實加強安全管理。」
記者在網上查詢D3115次列車時刻表看到：D3115次列車到達永嘉時間為19:47，開出為19:48。而據網上公布的調度記錄顯示：20:14分，調度布置D3115（CRH1-049B）次永嘉站開車，通知司機區間遇紅燈後轉目視模式20km/h運行。
《南方周末》在7月28日的題為「高鐵之亂：不可能的事故」一文中說：「D301的乘客們還對在永嘉站停車不解，實際上它在永嘉並不需要停靠。同樣感到奇怪的還有D3115車16號車廂乘客宋建新。他乘坐的火車在永嘉進站後不久，旁邊車道很快駛來另一輛動車D301。宋建新之所以注意這輛車， 是因為他發現這輛車的車廂都是臥鋪，但乘客卻都坐著。」
D3115在D301之前開走，這一事實在後來曾引起廣泛質疑——按照列車時刻表，它本應在D301後面。
一位有著20年駕齡的火車司機對《南方周末》記者解釋，此行車安排符合鐵路系統的 「潛規則」：D301晚點起自濟南局而非上海局，而統計列車晚點的指標是按趟數而非晚點程度來計算，由於D301已經晚點，調度員索性讓它再晚一點，給 D3115讓路，以盡力保證後者不晚點。這樣雖然D301會晚點更多時間，但在統計上，晚點趟數卻只有一趟。
業內人士：將列車調序是為業績指標
北車集團工程師魏明（化名）接受大紀元記者採訪時表示，說到底，把D301次列車放到D3115次列車之後的目的，就是為了業績、為了考核指標，而不是為了正常運行的次序、乘客的感受和安全的需要。
魏明認為：「如果規程不允許，調度為什麼還擅自做主，我認為肯定不是，應該是得到上級的授權，由於媒體報導類似故障已發生多次，造成晚點，影響很大。『高鐵世界第一』中央、喉舌媒體都喊出去了，鐵道部迫於壓力，在規程之外，下額外命令，超越規程，調度當然得執行，要不就扣錢，甚至下崗」。正因為中共死撐「中國速度」的高鐵秀，最終釀成悲劇。
另據一位鐵路內部人士解釋：每次事故之後鐵道部均急於通車而疏於救援，是因為鐵路內部考核事故嚴重程度是以事故阻斷交通時間長短來定的，而且以晚上六點為一個時間節點。這正是此次動車追撞事故為何非得趕在次日十八點前通車的原因。在中共多年形成的事故處理價值觀里，根本就沒有人命的位置。