北京國防大學2號院被封閉（視頻截圖）
6月16日，北京疫情持續快速蔓延，從新發地批發市場向全北京各地的農貿市場輸送病源，目前已知玉泉東市場、廣外天陶紅蓮菜市場、西城區一菜市場已經有確診病例，再由此向各個社區蔓延。現在許多社區都傳出聚集性感染疫情。
6月16日，北京官方公布的確診病例已過百，但知情人透露實際的數字遠不止這些。除了豐臺區進入戰時狀態，許多社區已經開始實施封閉式管理，如永定路、鐵建、西里、六建、嘉德公寓、白朗園、十一院、二院、國防大學2號院已經全部封閉。另外許多醫院也相應成為重災區和聚集性感染源頭，如721醫院、武警醫院都正在進行核酸排查。
網友發布的視頻顯示，北京回龍觀八高西側果之味超市的員工，發生聚集性感染，有2名員工發燒，3個病倒。6月16日，超市關閉，所有的員工將進行隔離排查。
海淀區玉泉東市場因爆發聚集性感染已經關閉，市場周邊10個社區實施封閉管理，目前正對近14天去過玉泉東商品交易市場和新發地市場的人員進行全面排查和核酸檢測。
受玉泉東市場的影響，國防大學2號院被封閉，對院內所有人員進行核酸檢測。據悉院內服務區一個賣肉商戶的與玉泉東市場一個商販有聯繫，而且兩人都確診。他們都從新發地生鮮市場進貨。
因疫情快速蔓延，被封閉的小區越來越多。如永定路、鐵建、西里、六建、嘉德公寓、白朗園、十一院、二院等都被封閉。許多醫院也處於高風險之中。
據中共官方媒體報導，因廣外天陶紅蓮菜市場員工人員被確診，從6月16日起，對廣外天陶紅蓮菜市場周邊7個社區的居住小區實施封閉管理。而豐臺區新發地批發市場周邊11個社區、海淀區玉泉東商品交易市場周邊10個社區也都實施封閉管理。到目前為止，北京已關閉十多家農貿市場，並對周邊的社區實施封閉管理。北京市大興區圖書館緊急關閉，但沒有披露原因。
這次疫情劇烈爆發，不只限於北京，而且向全國各地蔓延。北京的「南大門」河北保定市也已經進入「戰時狀態」。另外，北京的疫情已擴散到外省。遼寧省6月12日通報的新增無症狀感染者，均為北京市確診病例的密切接觸者。