針對判決，台灣總統府在第一時間發表聲明說，傳播民主理念無罪。聲明表示：「李明哲因關心中國大陸公民社會與民主發展，分享民主自由理念卻遭中國大陸法院以『顛覆國家』罪名審判，我們無法接受，也呼籲北京當局早日放人，讓李明哲儘速返台。」總統府的聲明指出，李明哲案嚴重傷害兩岸關係，尤其挑戰台灣人民對於民主自由的堅持與想像，令人遺憾。
