1943年10月,蓋世太保發現了艾琳娜拯救猶太兒童的真相後,將她關進了帕維亞克監獄,並對她進行了嚴刑拷打,打殘了她的雙腿。艾琳娜咬緊牙關忍受著一切,自始至終沒有吐露任何一個孩子的下落,沒有出賣過任何一個同伴。納粹最終判處她死刑。由於波蘭地下抵抗組織給了蓋世太保行刑劊子手一大筆錢,艾琳娜被放走,才僥倖逃過了一死。之後,她以假名繼續在波蘭生活。