這個時候,美國加州聖地亞哥軍事基地的一位上校擅自命令B2轟炸機起飛,前往南聯盟轟炸中國使館。B2飛抵南聯盟之後,發射的第一枚飛彈從屋頂貫穿副樓,直達地下室。這枚飛彈彈頭裡的炸藥全部拿掉了,只是起到一個打洞的作用。所以,這枚飛彈到達地下室之後,就躺在地下室了,後來被中國媒體挖苦為啞彈,說美國武器的質量也不咋地。第二枚飛彈只有微量炸藥,沿著第一枚飛彈打出的洞,穿到地下室後爆炸,將F-117殘骸炸個稀巴爛。第三枚飛彈橫穿二樓,將二樓的通訊設備全部摧毀。