總統府副秘書長有兩位，一位負責對內，主責協調府、院、黨事務；另一位特任副秘書長負責對外，協助處理國安外交事務，若總統與秘書長出訪，這位特任副秘書長還要代表總統主持「留守會議」，其經手的外交國安機密文件不知凡幾，也被稱為「大副秘」，何志偉將出任的職務屬之。此外，相較於總統府秘書長多由地位崇隆的政壇耆老出任，總統府特任副秘書長的職務常被賦予許多政治想像，在政壇上常被視為「總統的分身」，看到他出現，就如同總統親臨。
