(圖：百年前清朝醫官鏡頭中的拉薩)
清是東北的滿族人滅了明入主中原建立的王朝，是少數民族對多數民族的異族統治。為了控制地廣人多的漢族地區，滿人不得不聯合蒙古人彌補自己以少治多的力量不足。然而同為北方民族，滿清政治家又深知蒙古在歷史上摧毀過許多強大王朝，威脅性極強。為了自身安全，滿人必須能同時控制蒙古。為了實現這個目的，滿人要玩弄連環套的統治術──藉助蒙古人在軍事上控制漢人，再藉助西藏佛教在精神上控制蒙古人，他們就必須不畏西藏的山高路遠去經營西藏和控制藏人。
自蒙古人的元朝帝王接受藏傳佛教以來，藏傳佛教逐步成為蒙古全民族的信仰，西藏的佛教領袖也成為蒙古人共同的精神領袖。滿清統治者認識到，如果能夠控制西藏和西藏的的宗教領袖，那就可以在很大程度上控制蒙古人。反之，如果不進行這種控制，西藏和蒙古自己聯合起來，就很容易形成禍根。輕則失去西部百萬里之地，重則威脅整個大清的社稷江山。那些所謂的維護國家統一、堅持主權完整等目的都是後人的杜撰，肯定不是當時滿清皇帝考慮西藏問題的出發點。
為了利用西藏宗教和對西藏進行籠絡，滿清皇帝帶頭推廣藏傳佛教，包括自己受戒。順治年代，五世達賴喇嘛應邀到北京，順治皇帝親自出城迎接。當時採取的禮儀是二人平起平坐。藏人後來因此而強調，達賴喇嘛與清朝皇帝是"帝―師"關係，而非"君―臣"關係。不過，在那種表面的尊崇之下，其實存在著很強的利用之心。以乾隆的話說："興黃教，即所以安眾蒙古，所系非小。"乾隆還特地以"非若元朝之曲庇諂敬番僧也"的說法來表示這種利用關係。清代史學家魏源對此也總結："衛藏安而西北之邊境安，黃教服而准蒙之番民皆服"。
除了從宗教和感情上籠絡西藏，清朝也對西藏採取了政治、行政和軍事上的措施，以達到對西藏的控制。清初中國經康熙、雍正、乾隆三朝盛世，國力強大，在當時的亞洲首屈一指，周邊勢力無能與之匹敵。而當時西藏內訌不已，戰亂紛爭，以達賴為代表的藏傳佛教格魯派與自元以來統治西藏的蒙古汗王爭奪權力，各方勢力都要尋求靠山和保護者，也需要一個居高臨下的仲裁權威，清王朝正好就是這樣一個角色。當時每逢西藏地方統治者之間發生紛爭，各方都向清廷申辯和解釋各自的行動，爭取清廷援助，清廷也就利用那些時機，或是派兵入藏平亂安撫，或是進行審判裁決，得以實現對西藏的進一步控制，擴大清對西藏的權力和影響。清對西藏進行的重大制度變動或人事變動，幾乎都是在對西藏用兵後挾餘威完成的。這是當時西藏與清朝之間的典型關係。
從另一個角度而言，西藏當時還有抵禦外敵侵略的問題，它北鄰強悍的準噶爾蒙古，南與善戰的廓爾喀人接壤，它自身實力不足以抗衡侵略。而能得到大清的保護傘，便可威懾侵略者不敢輕舉妄動，即使發生戰爭也可以得到救援。清政府利用西藏的這種需要在西藏駐軍，系統地控制西藏的要隘、大路等軍事要害，從而進一步控制了西藏。
