後來，中共外交部聲稱昆明暴恐事件現場發現了「東突」旗幟。《人民報》質疑：既然宣布殺手都是維吾爾族人，長的都是新疆人模樣，還擺上「東突」旗幟幹麼呢，這豈不是畫蛇添足?!
報導引述現場目擊者的話說，非常詭異，警察來了，看到血肉橫飛的場面卻不開槍救人，周圍民眾一再大聲疾呼：開槍!開槍!開槍!警察才勉強開了槍。
3月2日，海外中文網站刊登龔英輔的評論文章質疑：
1、媒體報導，發動血案的這十個人統一著黑色裝。疆獨分子組團發動襲擊，從來沒有統一著裝的傳統，因為統一著裝，還沒有到達作案現場，可能就被發現了。迄今沒有看到過疆獨或東突分子統一著裝發動襲擊案例。
2、昆明血案中，這夥人全部使用長砍刀，逢人就砍，且均是要害部位，訓練有素。東突(疆獨)要組織這樣一次大型血案，都會使用槍，而不會都用砍刀。穆斯林恐怖組織訓練殺手和死士，用各種槍，炸彈，獨沒有聽說訓練用刀砍的。他們哪怕只有一支槍，其開槍所產生的震撼和威懾作用，比用刀殺人效果更大。所有恐怖份子都喜歡用槍，特別是AK47作案。在新疆或雲南兩地，買到或搞到幾支槍不是難事。關鍵是：如果東突組織有預謀的發動這次大規模襲擊，會沒有槍枝或炸藥嗎?
3、東突或疆獨分子在意識上均屬於狂熱的原教旨穆斯林分子，他們製造血案，更願意針對政府機關、軍隊、公安機關，乃至政府的附屬機構，以達到其所謂的政治和宣傳目的。殺害兒童、婦女和老人是違背穆斯林古訓的。因此，從常理上來說，東突(疆獨)組織要發動一次有政治目的大規模殺人血案，昆明火車站很難會成為首選目標。
龔英輔質疑：那麼這一夥實施血案的暴徒是屬於哪一個組織呢?是誰在背後策劃組織和提供物力財力的呢?最大可能，這次血案是衝著新領導班子深化改革和認真反腐敗所策劃的，是為給新領導集體主導的兩會製造難堪，更主要的是企圖轉移視線和改變反腐敗工作的方向!如果這個分析成立，這種團伙統一著裝的暴力血案還可能會在其他地方重演，中央必須抓緊防範和打擊!特別要防範和清理來自內部的麻煩製造者，順藤摸瓜抓住其策劃、組織和提供資助者。
退休老將軍提前獲悉昆明血案
此外，據新唐人電視台報導，有退休老將軍事後聲稱，3月1日出事兩三個小時之前得到內部秘密通知：「有歹徒要殺人，不要上街散步!」蹊蹺的是，這位退休老將軍並沒住在昆明!
海外《人民報》引述知情人話透露：江系血債幫在兩會前夕、在五個城市都布置了殺手，要同時下手瘋狂殺戮平民。那位退休老將軍是居住在其中的一個城市裡。但是，那個城市並沒有發生昆明那樣的慘案。看來，只有雲南省委忠實執行了江澤民集團的命令。
此次暴力砍人事件發生在昆明，外界也有很多猜測。有消息稱，昆明是中共14軍駐地，14軍是由薄熙來之父薄一波創建，是薄一波的嫡系，與薄家的關係盤根錯節。而14軍此前被指曾參與周薄政變。
歷史驚人相似再現江澤民集團導演天安門自焚偽案
歷史近乎驚人的相識，此次由江澤民政變集團導演的昆明殺戮案和13年前江派一夥導演的天安門「自焚」偽案手法同出一轍，諸多疑點相似，江派政法委特種武警參與，事件當事人被滅口、中共高層事先獲悉此案。
