官方的說法遭到民眾質疑。新疆人士胡先生接受大紀元採訪表示，此事件政治成分很大，首先是時機的選擇——在中共兩會召開前夕，而且目的明確，暴力手段製造恐怖事件。
胡先生表示，作為新疆人，他很了解，中共的維穩控制很嚴，如果此案的行兇者是從新疆到昆明的新疆人，大批的新疆人出行，會被跟蹤的。他們情況會被官方掌握的，怎麼會順利到昆明實施暴力襲擊；如果他們是本地居住的新疆人，他們平時也會受到監控，因此他懷疑是中共自導自演的駭人慘劇。
胡先生說，中共定性為「新疆分裂勢力一手策劃組織」，就為其在兩會期間暴力維穩做好鋪墊，中共軍隊可以擴權維穩，可以調動部隊開槍屠殺百姓。
發生如此重大傷亡的惡性事件，目前大量中共官方媒體保存緘默，只有新華社等喉舌媒體發出的籠統消息。對此民間呼聲極大，追問事件真相。
還有質疑稱，過往新疆暴力事件並沒有針對平民，主要是針對中共政府部門及警察，象昆明暴力事件大規模針對平民的還是第一次。而之前的新疆7·15事件維漢衝突也一直被外界質疑背後是中共在挑拔民族仇恨。至少昆明暴力事件開始之時，未有現場目擊者報稱兇徒具有新疆維人的特徵。
