國立中央研究院
1940年3月5日，72歲的老院長蔡元培去世。在舉國哀悼之際，新院長的選舉也提上了議事日程。
根據《中央研究院評議會條例》第五條規定：「中央研究院院長辭職或出缺時，推舉院長候補人三人，呈請國民政府遴選。」
當時的院士中，翁文灝、朱家驊、王世傑三位呼聲較高，都是候補院長的合適人選。
但臨到評議員們投票選舉新院長的前兩天，蔣介石卻叫陳布雷帶來一張條子，希望選舉顧孟余為新院長。
顧孟余早年留學德國，先任教於北京大學，後出任廣東大學校長。1927年步入政界，先後出任過宣傳部長、鐵道部長、中央政治委員會秘書長、交通部長。傅斯年在寫給胡適的信中說：平情而論，顧孟余清風亮節，有可佩之處，其辦教育，有歐洲大陸之理想，不比朱家驊、王世傑差。
但問題是，蔣介石下條子破壞了選舉章程，將三選一變成了一選一，而且是不經推選的唯一指定候選人，這和直接任命有什麼區別呢？
一時間群情沸騰，眾聲喧譁，陳寅恪更是直接反對說：我專程從昆明趕來重慶，為的就是要投胡適一票。
3月23日，中研院評議會正式選舉新院長，窗外春雨瀟瀟，室內筆端凝重。會議由王世傑主持，採用無記名方式投票。選舉結果：翁文灝與朱家驊各24票，胡適20票，李四光6票，王世傑與任鴻雋各4票。
蔣介石下條子的顧孟余，不被大家認可，沒有選中。翁文灝和朱家驊知道老蔣屬意的人選是顧孟余，自己也不想當。老蔣於是叫孔祥熙打電話通知胡適從美國回來。
孔祥熙隨即電告胡適，讓他辭去駐美大使一職馬上回國。但胡適拒絕回國擔任中央研究院院長。最終，院長一職落到了朱家驊肩上。
對於這樣的結果，陳寅恪和傅斯年表示滿意。畢竟他們反對下條子的目的，是拒絕行政干預，堅守學術獨立的精神。老蔣指名的新院長被成功阻擊，他們的堅持就達到了目的。蔡元培先生如果地下有知，定然會感到十分欣慰。
中央研究院成立於1928年，是中華民國最高學術研究機構，地位和教育部平行。蔡元培是首任院長。但中研院成立後，因連年戰亂，一直沒有條件選舉院士，直到蔡元培去世，抗戰勝利，才開始了籌備院士的選舉工作。
中央研究院院士，是中華民國設立的科學技術方面的最高學術稱號，為終身榮譽。
國立中央研究院年會攝影
1947年4月，由各方選出的15人組成第一屆院士選舉籌備委員會，制定出台了《院士選舉規程草案》，由此拉開院士選舉的序幕。籌委會下設三個小組：1、數理組，成員有吳有訓、茅以升、吳學周、謝家榮、凌鴻勛）；2、生物組，成員有王家楫、羅宗洛、林可勝、汪敬熙、秉志；3、人文組，成員有胡適、傅斯年、王世傑、陶孟和、李濟。
1947年5月16日，院士候選人提名在全國展開。到8月20日提名截止，由各大學院校、各專門學會、各研究機構及學術界著名人士，共提名院士候選人510名。
北大校長胡適是院士選舉「人文組」的召集人，具有相當大的學術權力。人文組院士的推薦標準是：發現、掌握新材料，提出新問題者。類別包含哲學、中國文史學、歷史、語言、考古、法律等10類。中國文學類不推薦文學創作的作家，只推薦研究語言文學的專家。哲學類不推薦玄學論者，而側重於實證的哲學史家。從全部候選人的提名表中可以看出，胡適一人的提名就多達119人。胡適沒有提名馮友蘭，認為他的「見解多帶反動意味，保守趨勢甚明，而擁護集權的態度亦頗明顯」。
此時，因高血壓在美國就醫的傅斯年看到初選的公示名單，分别致信朱家驊、翁文灝、胡適、薩本棟和李濟，對人文組提名劉文典和潘光旦，提出了否決意見。傅斯年在信中說：
候選人中確有應刪除者，如劉文典君。劉君以前之《三餘札記》還算是佳作，但其貢獻絕不能與余、胡、唐、張、楊並舉。作為學人，論其貢獻，其最後著作最為重要。劉君校《莊子》，甚自負，不意歷史語言研究所之助理研究員王叔岷君曾加檢視（王君亦研究莊子），發現其無窮錯誤。校勘之學如此，實不可為訓。劉君列入，青年學子當以為異。更有甚者，劉君在昆明，自稱「二雲居士」，謂是雲腿與雲土。彼曾為土司之賓，土司贈以大量煙土，歸來後既吸之又賣之，於是清華及聯大將其解聘，此為當時在昆明人人所知者。斯年既寫於信上，當然對此說負法律責任。今列入候選人名單，如經選出，豈非笑話。學問如彼，行為如此。故斯年敢提議將其自名單中除去。（《傅斯年遺札》第三卷，1340頁）
對於潘光旦從事的社會學，傅斯年認為，潘光旦研究譜牒學的結論，實在不能成立。他借科學之名，證明蘇州人天資優越，但這種說法根據不足，不能成立。（《傅斯年遺札》第三卷，1342頁）
正式提名結束後，選舉籌備委員會於8月27日至10月13日連續召開四次評議會，按照《選舉規程》對各方提名進行嚴格初審，在提名的510人中，刪掉了108人，留下402人。
10月15日至17日，評議小組再次召開會議，審議402人的名單，從中選出150人作為院士候選人。
按照《選舉規程》，院士的選舉資格：其一，是對研究的專業有特殊著作發明或貢獻；其二，應是專業學術機關的領導或五年以上主持，成績卓著。二者符合其一，即可當選院士。對於候選人的學術水平，是考察重點。
1948年3月9日袁翰青致信中央研究院評議會，主張「寧缺不濫」，以免貽笑於國際科學界。他指出化學一科中的紀育灃，在化學界雖為前輩，亦偶有論文發表，「但所發表之論文均無創見」，他的實驗僅限於「嘧啶」，是他美國導師的工作範圍。而其導師的論文在化學界已被公認為二三等論文。「紀先生二十年來只知做其博士論文之延續，無異自認其尚無自尋門徑，獨立研究之能力。國內類似紀先生之有機化學家為數不少，今獨選舉紀先生為院士，恐既不能使國內化學界心服，亦不免使國際化學界訝異也。」
此前3月6日，醫師王和夫也致信選舉籌備會，說「候選人中行政人員太多」，而且「貴院評議員全部列名，最受國人攻擊。還以退避為是」。又馬文昭醫師，「此人老朽昏聵，他根本無研究之素養、熱心與能力，所有數篇非驢非馬之研究皆是技術員、助手及友人代作代寫。關於忌煙之研究與治療全是詐騙，他用於忌煙之蛋黃素雜有嗎啡，不能根戒菸癮。貴院評議員林可勝及吳憲二先生熟知此人，可請其作證也。」
袁翰青、王和夫與傅斯年三人的信分別被選舉籌備會作為「極密件」第一號、第二號、第三號刻印件，分發給評議員「作為參考資料」，讓「評議會討論」。結果是紀育灃、馬文昭、劉文典、潘光旦四人都落選。
1948年3月25日下午評議會開會審查院士名單，到27日院士名單最終確定。其間先後五次投票，共選出院士81人。其中數理組28人，生物組25人，人文組28人。
數理、生物兩組，在第二次投票便已確定。惟人文組第二次增加柳詒徵，第三次加顧頡剛，第四次加余嘉錫，第五次加吳敬恆。足足經過了五輪投票。
評選結束後，當選院士名單在國民政府公報中公告，同時呈報國民政府備案。每位當選院士，由中央研究院發函通知本人：
敬查先生業經當選為本院院士。除關於當選院士證書、證章正在設計式樣，俟另寄奉外，相應檢奉院士名單，函請詧（察）照。此後尊址如有移動，並希隨時示知，以便通訊為荷，此致××先生。代理院長朱家驊。附名單一份。」
從選舉的最終結果看，81名院士的選出，是否做到了盡推盡選，也未必。當時便有人指出，因提名辦法不佳，導致有些應入選者未被提名。而數理組和生物組的人選，更多體現出對一些學科奠基人貢獻的尊重。有些學生、弟子的發明、貢獻事實上可能比老師還強，但因為是選舉第一屆院士，所以把機會給了老師，把未來留給學生和弟子。
不過無論怎樣，第一次院士的選舉，從總體看都是值得肯定的，她不但沒有受到行政干預，而且還超越了政黨政治，體現了學術獨立的原則。從郭沫若的提名到當選，可謂是一個最好的例證。
最初，提名郭沫若的四家單位，是代表北京大學的校長胡適、清華大學校長梅貽琦、中央研究院史語所所長傅斯年、河南大學校長姚從吾。
郭沫若這個人，政治立場反覆，人品極具爭議，不少人是持反對意見的。但胡適根據郭沫若甲骨文和上古史研究的成果，依然堅持提名並確保他成功當選院士。
夏鼐作為傅斯年的代表，曾參加了院士選舉會議，親眼見證了關於郭沫若提名資格的辯論。
問題是胡適提起的，他詢問會議主席朱家驊，對提名郭沫若有何意見。朱家驊謂其參加內亂，與漢奸罪等，不宜列入。總幹事薩本棟擔心，如果提名郭沫若，恐刺激政府，對於將來的經費撥款會有影響。吳正之則擔心郭將來以院士地位，在外面亂發言論。對此，巫寶三起立反對，認為不應以政黨關係，影響其學術貢獻；陶孟和說，如果以政府意志為標準，不如請政府指派；胡適贊同應以學術立場為主。雙方各自表示了不同意見，最後採取無記名投票做出決定。夏鼐因為是列席者不能參加投票，無表決權，乃起立闡明自己的看法，認為主要看學術成果，政黨立場不妨從寬。
表決結果，以十四票對七票通過，將郭沫若列入候選人名單。
2023-10-31