早在明崇禎十六年(1643年)和清順治六年(1649年)，沙俄殖民者波雅科夫和哈巴羅夫，曾先後率領哥薩克騎兵，越過外興安嶺，竄入我國黑龍江流域，趁機占領了尼布楚、雅克薩等大片土地，並在那裡強行修建了尼布楚、雅克薩兩城。
沙俄殖民者的侵略，曾激起了我國東北各族人民的堅決反抗，他們目睹敵人的野蠻強暴，採取堅壁清野的辦法，常常使敵人尋找不到糧食。
在哈巴羅夫強盜入侵那年的冬天，便有五十位中國人，被他們殺死吃掉了。過了兩年，當哈巴羅夫被迫撤退時，又殺死了我男俘661人，劫掠婦女兒童243人。
康熙帝親政後，對於沙俄的侵略行徑，極為義憤。他說：「朕十三歲親政以後，即留意於此，細訪其土地形勝，道路遠近及人物性情。」(《清聖祖實錄》卷121)在平定「三藩之亂」以後，康熙帝馬上著手，準備反擊沙俄。
康熙二十一年(1682年)，康熙帝親自到東北視察邊情，下諭做好自衛反擊戰鬥的準備工作。康熙二十四年(1685年)，他命令都統彭春、副都統郎談和黑龍江將軍薩布素，率領清軍水陸並進，一舉戰敗了盤踞雅克薩的沙俄侵略軍，逼使他們撤退北逃。但當清軍返回駐地時，沙俄侵略軍，又重新占領了雅克薩城。次年，康熙帝命令清軍再次討伐，圍困雅克薩城，斷絕城裡的水源，並多次擊潰企圖逃竄的沙俄侵略軍。沙俄政府，深感侵占我國黑龍江流域的野心，一時難以得逞，只好被迫同意清政府一再提出的和平倡議，通過談判，劃定了中俄兩國東段的邊界，從而取得了「雅克薩之戰」的勝利。
康熙二十七年 (1688年)，康熙帝親自向談判代表作出指示：「尼布潮(楚)、雅克薩、黑龍江上下，及通此江之一河一溪，皆我所屬之地，不可少棄於鄂羅斯。」(王氏《東華錄》康熙朝41)。談判開始後，俄方代表戈洛文，竟無理提出要以黑龍江為兩國國界的要求，被清朝談判大臣索額圖，嚴詞拒絕。在談判拖延過程中，漠西準噶爾部反動貴族噶爾丹，與沙俄秘密勾結。鑑於這種形勢，康熙帝考慮到不宜把戰線拉得太長，應有足夠兵力，來對付西北變亂；要爭取早日締約，因而可作讓步以額爾古納河為界，並把這一精神，關照了談判代表。俄國政府也因國內局勢不穩，便接受了這一建議。於是，雙方在轉年(1689年)簽訂了《尼布楚條約》。條約規定的主要內容是：
一、中俄兩國，以格爾必齊河、額爾古納河和外興安嶺往東至海為界，外興安嶺以北、格爾必齊河、額爾古納河以西，屬俄國；外興安嶺以南、格爾必齊河、額爾古納河以東，屬中國。
二、拆毀雅克薩城，俄軍可以攜帶財物撤回俄境；中國同意將貝加爾湖東邊尼布楚一帶，原屬中國的地方讓給俄國。
三、現住於雙方境內的兩國人民，不必遣還。兩國友好相處，兩國人民可以持護照，越界貿易。
《尼布楚條約》是在中俄雙方平等互利的基礎上簽訂的，它從法律上，確定了中俄兩國東段的邊界，肯定了黑龍江和烏蘇里江流域直至庫頁島的全部地區，都是中國的神聖領土！因此，《尼布楚條約》的簽訂，是康熙帝在外交政策上的重大勝利。
正是：
巍巍華夏，泱泱博大；
千古文明，輝耀天下。
國土神聖，苑育奇苑；
滋養萬邦，永惠無涯。
寸土如金，不許侵踏。
可恨江賊，媚俄賣國；
拱送寶地，喪我國格；
千古罪孽，惡報無竭。
天必滅之，勢在不赦！
（事據《清史》等）
