中華民國軍方七月一日早8點15分發射雄風三型飛彈發射離架事件，國民黨政策會執行長蔡正元8點54分就在他個人臉書揭露這件事，外界猜測，軍方內部可能有人通風報信。一日下午他在接受媒體訪問時更語出驚人地說，這枚誤射的飛彈，是瞄準廈門，從台灣看是打中漁船，從大陸看是被漁船擋住，否則被打中的是廈門，如果大陸反擊系統自動啟動，高雄恐已毀於戰火。
「目標瞄準廈門」的說法雖然聳動，但是否真的誤射仍然疑點重重，海軍131艦隊長胡志政在記者會說明誤射的原因是，當時，飛彈中士高嘉駿執行裝備測試，在測試程序完成後，卻立即進入到發射程序，期間，他又誤選了作戰模式，以及裝彈攻擊模式，造成雄風飛彈發射離架，這是事件的主因。
胡志政也指出，雄風三型飛彈的實彈射擊，須由幹部在場督導，但這次是裝備測試，高嘉駿卻自行進入射擊程序，因此當時並沒有幹部在場督導。
媒體也追問，如果是測試或操演，應該將飛彈控制系統維持在「訓練」模式，而非切換到「作戰」模式，為什麼切換？海軍參謀長梅家樹說，這也是目前他最急著想弄清楚的事。
大陸國台辦主任張志軍一日下午表示，這件事影響非常嚴重，台灣必須提出負責任的說明。被問到陸委會是否已經通報大陸，張志軍說，他沒有得到這個消息。
一日晚間，台灣陸委會表示，事件純屬意外，一日下午已授權海基會通報海協會，請海協會通知相關部門，陸委會也同步通報了大陸國台辦。晚間，國台辦發言人馬曉光響應媒體查詢是否收到台灣陸委會的通報時並沒有證實，只說：「關於兩岸聯繫溝通機制問題，此前國台辦發言人已多次作出了說明。」
前往搶救漁船的台灣海巡署官員表示，從翔利升號船艙遭貫穿的破損口分析，飛彈是貼著海平面3至4公尺高度飛行，貫穿了在漁船頂層的駕駛艙，當時駕駛艙內只有黃姓船長一人在掌舵，頭部被飛彈削破，傷重不治。飛彈以超音速貫穿漁船後並沒有爆炸，彈頭落入海中，中華民國軍方正在研究是否需要打撈上來，以防止泄密。
