台灣疾病控制中心的工作人員在台北桃園國際機場檢測從中國武漢抵達的乘客的體溫。（2020年1月13日）
台灣主管大陸事務的部門星期二（1月28日）說，因應中國大陸新型冠狀病毒肺炎疫情持續升高，即日起調升湖北省為紅色旅遊警示區域，其他省市為橙色警示區域。
台灣大陸委員會說，根據中央流行疫情指揮部的決定，調升湖北省旅遊警示燈號為「紅色」，建議民眾不宜前往，大陸其他地區（不含港澳）警示燈號為「橙色」，建議民眾應避免非必要的旅行。
在台北一捷運站里戴著口罩的台灣民眾。（2020年1月28日）
台灣境外旅遊警示信號分為四級：灰色（提醒注意）、黃色（特別注意）、橙色（建議暫緩）和紅色（不宜前往）。
路透社說，台灣還對大陸遊客訪台做出嚴格規定，禁止大部分陸客入境。
台灣《中國時報》星期二報導，中共拒絕台灣包機接回滯留武漢的台灣人。陸委會和海基會要求中國大陸允許台灣派包機將滯留疫情中心武漢的台灣公民接回台灣。但是中共國台辦對此拒絕。
