抗戰期間,國民黨軍隊除了在正面戰場與侵華日軍展開了22次大會戰、若干次中小戰役外,還在敵後採取游擊戰術打擊日軍。據統計,1938年,國軍參加游擊戰的數量在60萬左右。到了1941年,國軍游擊隊的人數是中共軍隊(連同游擊隊)總數的2.63倍,槍枝是中共軍隊的4倍。
國民黨正式確定敵後游擊戰是在1937年太原保衛戰前後。1937年9月國民黨河北守軍在涿縣戰敗,退守山西,部分軍隊奉命留在敵後開展游擊戰。在當年國民黨在武漢召開的軍事會議上,軍委會副總參謀長白崇禧更進一步建議,在戰術上「應采游擊戰與正規戰配合,加強敵後游擊,擴大面的占領,爭取淪陷區民眾,擾襲敵人,使敵侷促於點線之占領。同時,打擊偽組織,由軍事戰發展為政治戰、經濟戰,再逐漸變為全面戰、總體戰,以收『積小勝為大勝, 以空間換時間』之效。」白的建議為蔣介石採納,並在此後的作戰計劃中明確提出。
事實上,參與國軍游擊戰的除了奉命留在敵後的正規軍,還有由國軍軍官、地方軍人、國民黨黨務人員所領導的民間武裝部隊。這些武裝部隊一直活躍在敵後,打擊並牽制日軍。
1940年前後,國民黨敵後游擊戰到達鼎盛時期,建立了一批抗日根據地,華北有太行山、中條山、呂梁山、恆山根據地,華東華中有沂照山區根據地、浙西根據地、皖東皖北根據地、大別山根據地、鄂東根據地、大雲山九宮山廬山根據地,華南有海南根據地。全部兵力約100萬左右。此後國軍游擊隊雖曾遭遇挫折,但資料顯示,抗戰游擊區除冀察、魯蘇戰區到抗戰後期不復存在外,山西遊擊區、豫鄂皖游擊區、浙西遊擊區、海南遊擊區等,則一直堅持到抗戰勝利。
在八年抗戰中,國軍游擊隊除配合正面戰場大型會戰和戰役外,還有一些比較典型的游擊作戰的戰例,如鄭氏祠伏擊戰、突襲南澳島、呂梁山圍殲戰、攻占黃梅、鄂東反掃蕩、馬當夜襲戰等。
1938年5月,湖北省第二行政區專員兼保全司令程汝佳令游擊第5大隊、保全第8團的兩個營,配合第172師的兩個營,在鄭氏祠左右的高山占領陣地,伏擊日軍。經過一天激戰,國軍游擊部隊最終殲敵400餘人,活捉6人,繳獲槍枝彈藥若干。
同年7月15日,國軍第157師一部突襲粵東的南澳島,一度得手,然而戰至8月末,600餘突擊隊員僅剩20餘人生還,南澳縣長洪之政殉職。此役殲滅日軍200餘名。
1939年2月,日軍出動2萬餘兵力進攻呂梁山北部根據地,閻錫山令第61軍於黑龍關圍殲頑敵,第19軍向中陽、離石公路之敵發起襲擊。此役消滅日軍2000餘人。
5月初,日軍以飛機10多架、軍艦16艘、汽艇數十艘,配合陸軍向湖北大通一帶掃蕩。5月19日,第21軍軍長陳萬仞指揮部隊與敵激戰10餘天,將掃蕩之敵逼下長江。此役,擊沉汽艇20餘艘,斃敵900多人。
7月11日,鄂東遊擊隊集中主力圍攻黃梅縣城,擊斃日軍140多名,並奪取了縣城。
1940年秋,國軍第21軍147師組織了6個突擊隊,夜襲馬當要塞,斃敵150多人,焚毀了彈藥庫,並將要塞內的日軍大炮掉過頭來,對準江中的日軍艦船開火,擊沉、擊傷敵艦船多艘。此次夜襲戰,147師部隊沒有一人傷亡,此為抗戰史上一大奇蹟。
而在敵後戰場殉國的國軍將官,亦達數百人,軍階較高的有:東北挺進軍騎兵第6師中將師長劉桂五、東北游擊隊總司令中將唐聚五、第5戰區第2路游擊司令中將劉震東、蘇魯戰區政治部主任中將周復、第34軍暫編45師少將師長王風山、第98軍中將軍長武士敏、第51軍114師中將師長方叔洪等。
可以說,國軍游擊隊的存在,有效地起到了配合國民黨正面戰場、支持長期抗戰、牽制日軍並困擾其後方、協助國民政府恢復淪陷區政權、使淪陷區民心得到維繫的作用。