究其理由，一種說法原自豆漿中的「胰蛋白酶抑制劑」。其實它也是一種蛋白質，但它偏偏會阻礙人體對蛋白質的消化，讓生豆子當中的蛋白質消化率不足40%。如果吃了它，也會妨礙其他食物中蛋白質的吸收。
不過，只要經過烹調加工，大豆中的胰蛋白酶抑制劑就會大部分失活，於是，人們千百年來都在放心地飲用豆漿。關鍵在於豆漿的加熱時間，最好沸騰之後再小火加熱8分鐘，保證胰蛋白酶抑制劑的破壞率達到90%以上。既然豆漿中的胰蛋白酶抑制劑經加熱失活了，也就不會妨礙牛奶中蛋白質的吸收，兩者同飲，應當是毫無問題。和雞蛋一起吃，當然也一樣沒有問題。
另一種說法則來自於「蛋白質浪費」學說。說是早上人們的吸收能力有限，一杯牛奶或者一碗豆漿已經足夠營養，兩者同吃，則養分吸收不完，造成浪費。這種說法看似合理，實則無聊，只要細細分析，就能找出漏洞。
首先，一袋牛奶含有多少蛋白質？按2.9％的國家標準計算，250克牛奶不過是區區7.3克，只相當於輕體力活動成年男性一日蛋白質推薦供應量的10%，女性推薦量的11%。豆漿的蛋白質含量通常為2%，一大碗300毫升的豆漿，不過含蛋白質6克。牛奶與豆漿相加，僅相當於一日蛋白質攝入量的20%，怎麼能算是過量呢？
一袋牛奶，一大碗豆漿，加上2片麵包（約相當於60克麵粉），總共可提供19克蛋白質。按照平衡膳食的原則，早餐應當提供1/3的優質蛋白，應當是22~25克。可見，所謂牛奶加豆漿造成蛋白質營養過剩之說，根本不成立。
那麼，我們再來看看其他成分吧。
——牛奶中富含鈣，而豆漿中鈣相對較低，更富含鉀鎂。
——牛奶中維生素A豐富，而豆漿中不含有這種營養素。
——豆漿中維生素E和維生素K較多，而牛奶中這兩種維生素比較少。
——牛奶中不含有膳食纖維，而豆漿中含有大量可溶性纖維。
——牛奶中含有少量飽和脂肪和膽固醇，而豆漿含有少量不飽和脂肪，以及降低膽固醇吸收的豆固醇。
——豆漿中含有豐富的大豆異黃酮，可減少更年期婦女鈣流失，而牛奶中含有促進鈣吸收的乳糖和維生素D。
從以上比較可以看出，牛奶和豆漿的營養不僅不會疊加而損失，反而會因為互補而加強。
從補鈣而言，牛奶中有大量的鈣，以及維生素D和乳糖，如果得到豆漿中的維生素K和鉀鎂的幫助，就可以更加有效地提高鈣利用率，對提高青少年骨骼密度有所幫助；對於更年期的婦女來說，因為得到了豆漿中的大豆異黃酮，可以在飲奶補鈣的同時延緩鈣流失，起到雙管齊下的作用。
從美容的角度來說，牛奶中豐富的維生素B2和維生素A，有利於面部皮膚的更新和代謝，而豆漿中的大豆異黃酮可以提高皮膚的彈性和保水性。
從預防心血管疾病來說，牛奶中豐富的維生素B6、維生素B12，和豆漿中的葉酸、維生素E、大豆異黃酮和膳食纖維協同作用，可以有效降低同半胱氨酸水平，提高LDL的抗氧化能力，起到最佳的防病效果。
所以，無論怎樣考慮，奶類和豆漿，都可以作為最佳的營養飲料配合。如果有可能的話，早餐可以兩者同飲，或者，如果感覺體積太大，不妨用酸奶代替牛奶，或在早晨飲豆漿之後，用酸奶/牛奶作為上午的加餐。
[最後補充一點：牛奶含鐵很少，黃豆中的鐵吸收率很低（3%）。如果要補鐵，食用肉類才更為理想。我剛在網上看到有人說豆漿鐵含量高，因此認為補鐵方面兩者能夠互補，這種說法是錯誤的！。]
