據山東省消協最近的一次調查表明，目前市場上的牙籤多為木製和竹製兩種，消協工作人員在最近對多家餐飲店暗訪中發現，一些牙籤的外包裝上雖然標註「高級牙籤」、「高溫消毒」等字樣，但大多是「三無產品」，根本沒有衛生許可證號，牙籤包裝和消毒也達不到要求，有的放在盤中，人人隨手取用，有的把使用過的牙籤又放回盤中。
不正確的使用牙籤至少有四大危害：
首先是消毒不嚴、管理不善的牙籤易引起疾病。任人抓取的牙籤上附帶的各種各樣的細菌、病毒會通過牙籤進入人體內，據衛生部門化驗，一根小小的牙籤上竟「藏」著幾萬個細菌。
其次是牙籤使用不當，將導致牙周疾病。如果無塞牙現象而亂剔牙或牙籤使用不當就會造成牙齦炎、牙齦萎縮、牙間隙增大而導致牙周疾病，切不可將牙籤用力壓入牙間乳頭區，因為這樣會使本來沒有間隙的牙齒間隙增大造成牙周病。
第三，叼含牙籤不慎可能危及生命。據介紹，有消費者因叼含牙籤不小心吞進肚內，把小腸穿破，經醫院緊急手術開刀才從體內取出，險些丟了性命，類似患者近期該院已收治兩例。
第四，木製牙籤造成木材消耗巨大，據有關方面統計，全國每年要消耗超過6000億支牙籤，如果用木材製造需消耗木材160萬立方米，相當於203萬畝樹林;用竹子製造需消耗竹子140萬噸，相當於70萬畝竹材，韓國、日本等已開發國家目前已全面禁用木製牙籤。同時牙籤生產過程和使用後也對環境造成污染。
牙籤的衛生狀況和正確使用直接關係到牙齒的保健和口腔衛生，切不可掉以輕心。
首先，如果無塞牙現象就不要剔牙，同時，要養成每天正確刷牙的習慣;
其次，不要叼含牙籤，因牙籤頭部較尖，不慎進入食道，有生命危險，對於有牙齒疾病和食物嵌入塞牙的消費者，可選擇使用100%降解的澱粉牙籤;提倡用間隙刷代替牙籤，間隙刷是一種清潔牙齒鄰面菌斑食物殘渣的專用小刷子，使用間隙刷對牙縫清潔效果非常好，還能預防牙周疾病，因此，應大力倡導。
另外，選擇使用牙籤時，要選擇軟木製成的產品，表面要光潔無刺、尖端不能太尖，應該圓滑，要選擇包裝較好，有廠名、廠址、衛生許可證號、經過嚴格消毒的正規廠家的產品，沒有放在密閉容器內和可能引起污染的牙籤請不要使用。
