上任不足兩年的北京大學前校長王恩哥調任中科院後，外界傳言頗多。日前有海外媒體披露，王因利用出售專利的方式，從旗下企業北大方正集團獲利高達上億元而被撤職。另有消息指，北大方正數名高層近日因涉中央統戰部原部長令計劃貪腐案而被查，身為校長的王或同涉令案。另有指，原政治局常委、中紀委書記賀國強的兩個兒子亦捲入北大方正貪腐案。
王恩哥2015年2月被免去北京大學校長職務，另有任用，接任者為浙江大學校長林建華，王的去向及撤職原因一直成謎。王當日曾向傳媒透露，將調任中科院工作。
北大方正博雅酒店一度吸引很多媒體的眼球
現年58歲的王恩哥籍貫上海，曾任中科院物理研究所所長、副秘書長等職；2009年調任北京大學研究生院院長、物理學院院長；2011年升任北大副校長；前年三月任北大校長，未滿兩年就已經被撤職，成為北大近年「最短命」校長。
媒體報導稱，王恩哥被撤職的原因是他以出售專利的方式，從北大校辦企業北大方正獲利上億元。英國廣播公司（BBC）亦報導，北大方正前董事長魏新、前行政總裁李友，以及前執行總裁兼財務長余麗等五名高層，近日因涉令計劃貪腐案而被調查，身為校長的王也難免受影響。另有消息指，王恩哥被免職是因北大方正貪腐案被問責。
北大方正捲入大陸校辦機構前所未有的政治風波，案件至今仍在調查，然而有關李友向令計劃輸送利益等醜聞不絕於耳。早前有報導指，令妻谷麗萍是「西山會」的主要管理者，而李友則是主要資助者之一；谷去年底於北大博雅酒店與李友開會時被公安抓捕。另李友曾以日本豪宅行賄令家；而令計劃之子令谷2012年車禍身亡時，所駕的法拉利亦為李友所贈。
此外報導指，北大前黨委書記閔維方也曾從北大方正獲取暴利，包括賀國強之子亦捲入北大方正案，令該案變得更加錯綜複雜。
