武漢冠狀病毒疫情引發的北京與武漢的「甩鍋大戰」，終以湖北和武漢一把手被撤職暫時告一段落，而中南海和國務院衛生機構的輿論之爭又拉開帷幕，同時引發的對習近平政權的衝擊才剛剛上演，凸顯中南海高層內鬥。中央和地方，疾控中心和衛健委4方混戰。
中共黨刊《求是》雜誌2月15日全文刊登，習近平2月3日《在中央政治局常委會會議研究應對新型冠狀病毒肺炎疫情工作時的講話》。首次披露習近平在1月7日主持召開中央政治局常委會會議時，就要求對疫情進行防控。
但是翻查1月7日新華社和人民閘道器於這次會議的報導，全文未見習近平對冠狀病毒肺炎疫情防控工作提出要求，以及武漢肺炎相關信息。
日本的中國問題專家遠藤譽則認為，「求是」發布的會議發言根本是造假，因為新華社2月3日針對中共政治局常委會開會的報導，並未提及習在1月7日便下令防疫。
港媒《明報》2月17日的一篇文章則是將矛頭直接指向習近平中央。
署名鍾仕的評論文章，引述匿名「京城消息人士」稱，在1月7日的中共政治局常委會會議上，如何應對疫情並不是會議重點。最高領導人當時只提出要注意防範，但同時要求「不要因此造成恐慌而影響即將到來的農曆新年節日氣氛」。
文章說，直到1月20日，習近平才對疫情做出公開指示。1月23日武漢封城時，國務院新年團拜會上還一片「歡慶」氣氛，習近平對武漢疫情隻字未提。
文章說，在中央輕描談寫的指示下，在已發生人傳人病例後，湖北兩會照開，武漢也舉行盛大的萬家宴等聚會。消息人士還說，包括高福等專家，在中央及地方均未對疫情給予高度重視的情況下，採取了包括在國際期刊上發表論文的預警方式。
疫情發生後，包括武漢、湖北及中科院武漢病毒所等部門紛紛「甩鍋」。消息人士表示，有關專家並非如外界盛傳的那樣未盡責任，而是權力高層決策及基層執行環節都出現嚴重錯判。
該消息人士還特別提到，近來因疫情擴散而備受指責的中共疾控中心，早在1月6日就向中共中央部門通報疫情，而且當日啟動疾控中心內部二級應急響應，但在高層領導人不夠重視的情況下，這些專家不得不以在國際期刊發表論文等方式預警。
近日網絡上也流出一篇與以上明報指向習近平的輿論完全相反的文章，其中亦引述匿名「北京消息人士」，指控湖北地方當局和北京衛生機構的知情不報導、誤導中央致疫情失控。
該文章引述消息指，早在去年12月15日前，武漢醫生就報告武漢政府出現類SARS疫情，但武漢只是報告中共國家衛健委，毫無作為。直到患者倍增，醫護人員大量感染的情況下，武漢依然堅持等衛健委指示，拒不採取任何措施，理由是「避免引起恐慌，不利維穩」。
而中共國家衛健委專家組到武漢「考察」時，根本沒有接觸前線醫護，就匆匆得出「可防可控」的結論，聲稱「只要數周，情況就會基本好轉」，並如此上報中共中央。
這些做法激怒很多體制內人士，有武漢官員將官方內部文件交給美國駐武漢使館，還有人聯繫內參記者，將情況密報中南海。
趨勢網2月17日的一篇文章大批疾控中心負責人高福。文章說，2019年12月31日，以高福為首的第一批8名國家級專家組趕赴武漢，進行實地考察、採集樣本、收集數據。高福對外界信誓旦旦地表示：這種新型冠狀病毒「可防可控」，「不會人傳人」。打臉的是，專家隊伍中的王廣發醫生就感染了新冠病毒肺炎。而事實也證明，新冠病毒肺炎極易傳染，人傳人概率比薩斯時期還高。
2020年1月22日，就是武漢封城前，在新聞發布會上高福言之鑿鑿地說：「目前證據確實顯示兒童、年輕人對病毒不易感。」對外宣布疫情後，高福仍樂觀地表示：「按照現在的措施，大家認為元宵左右就會有所好轉。」而高福個人更樂觀，判斷能更早轉好：「我個人比較樂觀，甚至我個人評估比這個還早。」
旅美經濟學者何清漣表示，熟悉中共政治尤其是黨內鬥爭史的人都明白，哪怕上級錯得離譜，下級也是「奴才該死，臣罪當誅」。如果不是背後有人撐腰，借地方當局幾個膽子，也不敢公開「甩鍋」給中央領導。
美國智庫外交關係協會會長主席哈斯（Richard Haass）表示，這波疫情已構成習近平執政近七年及中共建政以來的最大危機，威脅遠甚於1989年六四事件。
