1、大豆
非基因改造大豆：為橢圓形狀，有點扁。肚臍為淺褐色。豆大小不一。打出來的豆漿為乳白色。
基因改造大豆：為圓形，滾圓。肚臍為黃色或黃褐色。豆大小差不多。打出來的豆漿有點黃，用此豆製作的豆腐什麼的都有點黃色。
簡單的檢驗方法：基因改造大豆不發芽!可以用水檢測!本土大豆用水浸泡三天會發芽!基因改造大豆不會發芽，只不過是個體膨脹而已。從這個發芽試驗過程，人們可以發現，這些基因改造大豆是一次性產生的果實，它們的胚芽是不具有生命本質活性的，因此，就沒有延續後代的能力。相當於——可以正常懷孕，但是每一次都是死胎，這就意味著生命的延續到此為止了。
2、胡蘿蔔
3、土豆
4、玉米
基因改造玉米：甜脆、飽滿、體形優美、頭顆粒尾差不多。
5、大米
在中國取得基因改造大米合法種植權的地區是湖北，要警惕細長很亮的米，容易與東北「長粒香」混淆。買的時候一定看清原產地。
6、番茄
基因改造番茄：顏色鮮紅很好看，果實較硬，不易裂果。
7、其他鑑別方法
進口水果的標籤。一般來說，在標籤的最下方一般印有出口國的名稱，中間的英文字母標明水果的名稱，最上方的英文字母標識的是出口企業的名稱。在每個標籤的中間一般有4位阿拉伯數字：3字開頭的表示是噴過農藥。4字開頭的表示是基因改造水果;5字開頭的表示是雜交水果。
(1)超市購買食品時一定要上心，先查是否有基因改造標註。根據《農業基因改造生物標識管理辦法》，基因改造食品應有標註。但這些標註怕見人，小到只有1.8毫米高，而且躲在最不顯眼處，仔細查總是可以查到的。
(2)超市番茄、木瓜大部份是基因改造，堅決不買。從安全和質量上說，個體農販水果類食品要比超市好得多。
(3)玉米使用基因改造最早、最廣、最多，購買任何玉米食品均要慎之又慎，哪怕超市賣的玉米窩窩頭。
(4)基因改造小麥籽粒色白透明發亮，全形質，屬硬質強筋優質麵包小麥品種，特優基因改造9506小麥2008年在安徽面世，麵粉中還有漂白劑、滑石粉混在裡面，就更難識別。
(5)水稻基因改造中國偷偷搞了好幾年，少數流入市場，特別要警惕又長又瘦又亮的大米。東北大米目前無基因改造，暫可放心，一定要看外包裝袋，如黑龍江、吉林和遼寧的米業，東北米是粳米，短圓粒型、這與湖北、湖南一帶種植的基因改造水稻(如BT汕優63)中長粒型有本質的區別、容易識別。另外，泰國禁止基因改造，其米無問題。
(6)小米、燕麥、蕎麥、高粱均屬小宗糧食作物，還來不及去基因改造。花生是我國獨特產品，暫無基因改造，紅薯也未基因改造。
8、生物共振鑑別法
將未知的食品與作為基準的非基因改造同類食品的生物頻譜場共振，如果共振，則是非基因改造的食品;不是，則是基因改造的食品。此操作簡易，適用面廣，但是技術難度較高
