第一種治療方法：對抗炎症
腎炎的發病機制與免疫複合物相關，大量免疫複合物是導致的炎症的「根源」，除此之外，還有細菌毒素、代謝產物長期沉積在腎小球內，造成炎症的發生，形成破壞。
比如腎小球腎炎、狼瘡性腎炎、IgA腎病等，都要及時給與免疫抑制劑及消炎藥的治療。消炎主要以糖皮質激素為主，免疫抑制劑可以選擇多種，其中除了激素，還有兩類藥物，ACEI和ARB也具有一定的抑制腎臟細胞炎症反應及硬化的作用，多用於糖尿病腎病、高血壓腎病等不適用激素的腎病類型。
第二種方法：預防併發症
腎病炎症反應階段以免疫抑制及消炎治療為主，發展到第二階段仍需要堅持消炎治療。此外，保護剩餘的腎功能，還需要及時治療併發症。腎病中後期最多發的併發症就是高血壓、高鉀血症、貧血等代謝紊亂疾病。腎臟是發揮著調節全身水、電解質、酸鹼平衡的作用，當腎臟腎小球單位受損過半時，腎臟各方面功能開始發揮失常，身體各項機能就會紊亂。
預防併發症的第一步是複查各項指標，如血鉀、血磷、血壓、尿酸、血肌酐等，如果穩定就繼續維持治療，如果出現異常，第二步就是針對性治療。對於血液內物質紊亂的情況，除了直接調理，用藥加速鉀、磷、尿酸等物質的代謝外，飲食管理也很重要，減少含鉀、磷、高嘌呤等食物的攝入，來長期維持體內各種元素的平衡，延緩腎臟的代謝壓力。
第三種：促進毒素代謝
毒素不能及時排出，就只能滯留在腎臟內，悄悄的損害腎功能。因此在抑制炎症、預防併發症對腎臟損害的同時，也必須加速毒素的代謝，為腎功能爭取更多痊癒的機會。
一般發展到腎衰竭終末期，腎小球濾過率僅有不到14ml/min，如果腎友又出現嚴重併發症如高鉀血症、心血管疾病等，則會選擇血液透析或腹膜透析治療，以及時置換出體內的毒素。
