李克強於港大出席百周年活動時，被安排坐上「校監椅」，加上訪港期間的保全，引起連串風波。
李克強逝世，香港人對他「最深刻印象」，莫過於2011年以副總理身份訪港，最後惹起連串風波。2019年香港爆發反修例運動，李克強接見時任特首林鄭月娥時，強調「一如既往地堅定支持林鄭月娥及港府依法施政」，豈料林鄭月娥最終得不到「祝福」，未能連任。
本來不為港人熟悉的李克強，2011年一次為期三天的訪港行程，令他的名字占盡報章版面。當時擔任國務院副總理的李克強，於2011年8月16日至18日訪港三天，重點活動是出席香港大學百周年校慶活動，不過就引起連番爭議。校方將他安排坐上校監椅，但按照慣例，校監椅是安排讓校監（港督/行政長官）、副校監、或校長使用；而同樣獲邀出席，且是李克強之外另一位發言嘉賓前港督衛奕信，則被安排在第二排坐位，因此被質疑港大校方甘願向國家領導人稱臣。而警方亦在港大校園內「執法」，將欲示威的學生禁錮在後樓梯，直至典禮結束才放行。
至於到訪其他地方參觀期間，香港警察亦起用大批警力，阻擋市民向李克強反映民意，有記者高聲向李克強提問而遭警察強行帶走；而李克強在麗港城家訪時，有麗港城住戶在大樓下穿上六四衣服，豈料又遭警察帶走，警方更以手阻擋在場攝影記者的鏡頭。時任警務處場曾偉雄否認警方在該次行程中使用過份武力，更解釋是警員的手剛好「卡在」攝影機之中。
到2019年香港爆發「反送中」運動，李克強在人民大會堂香港廳接見時任香港特首林鄭月娥時說，中央政府將一如既往地堅定貫徹「一國兩制」方針，一如既往地堅定支持林鄭月娥及港府依法施政，堅定不移地維護香港長期繁榮穩定。他又說，香港還沒有走出困境，希望港府繼續努力依法止暴制亂、恢復秩序，並要抓緊研究香港經濟社會發展當中一系列深層次矛盾問題，維護香港長期繁榮穩定。
在李克強今年3月發表任內最後一分《政府工作報告》，回顧過去5年港澳工作時表示，港澳工作取得新進展，依照憲法和基本法有效實施對特別行政區的全面管治權，制定實施香港維護國家安全法，落實「愛國者治港」、「愛國者治澳」原則，推動香港進入「由亂到治」走向「由治及興」的新階段。
在港澳政策方面則強調，要全面準確、堅定不移貫徹「一國兩制」、「港人治港」、「澳人治澳」、高度自治的方針，落實「愛國者治港」、「愛國者治澳」原則。
